Museum Anatomi Fakultas Kedokteran dan Ilmu Kesehatan Unika Atma Jaya diresmikan pada tanggal 5 Juni 1995 oleh Ketua Yayasan Atma Jaya, Prof. Dr. H. E. Harimurti Kridalaksana bersamaan dengan Lustrum ke-35 Unika Atma Jaya dan diberkati oleh Romo F.X. Krismanto. Berdirinya Museum Anatomi FKIK UAJ diprakarsai oleh dr. Liliana Sugiharto, MS. PAK (K), beliau belajar dari Museum Anatomi Katholieke Universiteit Nijmegen (KUN) dibawah supervisi Dr.L.M.G. Geeraedts. Pada tahun 2014, Museum Anatomi mengalami renovasi dan diberkati oleh Ketua Dewan Pembina Yayasan Atma Jaya sekaligus Uskup Agung Jakarta, Mgr. Ignatius Suharyo.
 

• Museum Anatomi Pertama di Indonesia milik Perguruan Tinggi yang terbuka untuk umum.
• Museum Anatomi Pertama di Indonesia yang terintegrasi antara ilmu biomedik dan klinik.
• Buka Senin- Jum'at ( 09.00-15.00 ) sesuai dengan perjanjian dan konfirmasi dengan Admin Official Museum Anatomi FKIK UNIKA Atma Jaya
• Sabtu ,Minggu dan Libur Nasional Tutup